蛋白质组修饰定量

日期:2016-07-26 / 人气: / 来源:未知

蛋白质组修饰定量
    蛋白质翻译后修饰(PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域。
    世宸结合先进的HPLC-MS/MS系统分析和生物信息学分析技术,提供磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等蛋白质组修饰定量技术服务。以磷酸化蛋白质组鉴定为例。 
磷酸化蛋白质组鉴定
服务简介
    蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式,它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程,所以磷酸化一直是生物学研究的重点与热点。磷酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的磷酸化位点。
   世宸基于高精度液质联用技术进行蛋白质全谱分析.应用TiO2富集肽段,特异性高;采用较流行的Ascore算法对发生在各位点的磷酸化修饰做进一步打分评估,从而正确辨别真实修饰位点。
服务流程
 接受订单及样品    蛋白提取   肽段酶解  磷酸化肽段富集   HPLC分离   LC-MS/MS   数据解析    结果交付
客户提供
需鉴定的样品;
样品信息单,需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
◎最终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
1、修饰蛋白、修饰位点鉴定
2、鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布
3、修饰位点motif预测
4、蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;
5、蛋白质网络互作预测(高级分析)
6、蛋白质Domain预测(高级分析)
7、磷酸化蛋白激酶预测(高级分析)
适用范围
已知物种基因序列、ESTs序列或蛋白序列全库
服务周期
自送样起45个工作日。
技术特点
富集方法特异性高,对低pH溶液、去垢剂、盐类、其它低分子污染物有更高的耐受性,容易与非磷酸化肽段分离通量大,世宸一次可以鉴定1000个以上磷酸化位点。
蛋白质修饰位点鉴定

服务简介
    蛋白质翻译后修饰(PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白质修饰位点能够影响蛋白的多种属性,包括蛋白质折叠、活性以及最终的功能,对于蛋白质修饰位点的发现及研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。
    世宸采用超高分辨率质谱技术结合生物信息学分析,提供磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、糖基化等蛋白翻译后修饰位点鉴定技术服务。
 服务流程
接受订单及样品  蛋白提取  肽段混合   修饰肽段富集   LCMS/MS   数据解析   结果交付
客户提供
需鉴定的样品:胶粒/条带、液体、干粉;
样品要求:
1、样品含量:50-1000Fmol(根据检测项目而定)
2、胶类样品:银染过程中使用戊二醛作为固定剂
3、保存方式:液体建议低温,胶类用去离子水防干
4、非胶样品要求:挥发性盐<20mM,无PBS、SDS和尿素等物质。
样品信息单:需详细填写样品来源,含量,状态及其他基本信息。
最终交付
实验报告一份,含实验流程、分析过程及数据结果
适用范围
已知蛋白序列;明确翻译后修饰的类型。
技术特点
时间快,周期短;
识别位点准确,采用超高分辨率质谱技术可以准确定位到发生修饰的氨基酸位点。
服务周期
自送样起20个工作日
咨询电话:0591-83300950

作者:admin


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